Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trim12cD3Z3L3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim12cD3Z3L3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim12cD3Z3L3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim12cD3Z3L3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim12cD3Z3L3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim12cD3Z3L3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim12cD3Z3L3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim12cD3Z3L3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim12cD3Z3L3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim12cD3Z3L3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim12cD3Z3L3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim12cD3Z3L3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim12cD3Z3L3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim12cD3Z3L3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim12cD3Z3L3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim12cD3Z3L3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim12cD3Z3L3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim12cD3Z3L3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms