Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn24D3YXJ9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn24D3YXJ9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms