Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna7C0LLJ0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna7C0LLJ0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms