Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppfia1B2RXQ2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms