Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Apba1B2RUJ5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms