Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phf3B2RQG2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms