Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Skint5A7XUY5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Skint5A7XUY5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Skint5A7XUY5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Skint5A7XUY5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms