Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E4

Ttll2, Probable tubulin polyglutamylase TTLL2, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll2A4Q9E4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttll2A4Q9E4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttll2A4Q9E4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms