Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms