Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Plcb2A3KGF7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Plcb2A3KGF7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 655.8 ms