Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Palm3A2TJV2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Palm3A2TJV2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms