Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CatsperbA2RTF1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CatsperbA2RTF1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms