Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Htra4A2RT60 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Htra4A2RT60 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms