Protein–RNA interactions for Protein: A2AX52

Col6a4, Collagen alpha-4(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a4A2AX52 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a4A2AX52 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col6a4A2AX52 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms