Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Upf2A2AT37 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Upf2A2AT37 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms