Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rtf1A2AQ19 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms