Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Frmpd1A2AKB4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Frmpd1A2AKB4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Frmpd1A2AKB4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Frmpd1A2AKB4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms