Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc183A2AJB1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms