Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VirmaA2AIV2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VirmaA2AIV2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VirmaA2AIV2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms