Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramel3A2AHA7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms