Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ambra1A2AH22 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms