Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmpd4A2AFR3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms