Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm884A2A9H6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm884A2A9H6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm884A2A9H6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm884A2A9H6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm884A2A9H6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm884A2A9H6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm884A2A9H6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm884A2A9H6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm884A2A9H6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms