Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C87977A2A958 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C87977A2A958 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87977A2A958 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87977A2A958 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87977A2A958 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87977A2A958 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87977A2A958 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87977A2A958 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C87977A2A958 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87977A2A958 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C87977A2A958 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms