Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prdm16A2A935 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prdm16A2A935 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Prdm16A2A935 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms