Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calcoco2A2A6M5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms