Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cul4bA2A432 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cul4bA2A432 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul4bA2A432 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul4bA2A432 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms