Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd2V9GX34 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms