Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt27Q9Z320 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Krt27Q9Z320 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Krt27Q9Z320 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Krt27Q9Z320 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt27Q9Z320 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
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Krt27Q9Z320 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms