Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Hdac5Q9Z2V6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hdac5Q9Z2V6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms