Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac6Q9Z2V5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac6Q9Z2V5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac6Q9Z2V5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac6Q9Z2V5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac6Q9Z2V5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac6Q9Z2V5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac6Q9Z2V5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac6Q9Z2V5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac6Q9Z2V5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac6Q9Z2V5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac6Q9Z2V5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac6Q9Z2V5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac6Q9Z2V5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac6Q9Z2V5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac6Q9Z2V5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac6Q9Z2V5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac6Q9Z2V5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac6Q9Z2V5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac6Q9Z2V5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
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