Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mbd3Q9Z2D8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms