Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngr4Q9Z1L2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr4Q9Z1L2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr4Q9Z1L2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr4Q9Z1L2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr4Q9Z1L2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr4Q9Z1L2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr4Q9Z1L2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr4Q9Z1L2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr4Q9Z1L2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr4Q9Z1L2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr4Q9Z1L2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr4Q9Z1L2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr4Q9Z1L2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr4Q9Z1L2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr4Q9Z1L2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngr4Q9Z1L2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms