Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo3Q9Z172 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sumo3Q9Z172 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms