Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne6Q9Z140 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms