Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z126

Pf4, Platelet factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pf4Q9Z126 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pf4Q9Z126 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms