Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0J7

Gdf15, Growth/differentiation factor 15, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf15Q9Z0J7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf15Q9Z0J7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf15Q9Z0J7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms