Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clip2Q9Z0H8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip2Q9Z0H8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms