Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
AireQ9Z0E3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AireQ9Z0E3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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