Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni1Q9WUZ5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni1Q9WUZ5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni1Q9WUZ5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni1Q9WUZ5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni1Q9WUZ5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni1Q9WUZ5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnni1Q9WUZ5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnni1Q9WUZ5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnni1Q9WUZ5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnni1Q9WUZ5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnni1Q9WUZ5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnni1Q9WUZ5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni1Q9WUZ5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni1Q9WUZ5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni1Q9WUZ5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni1Q9WUZ5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni1Q9WUZ5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni1Q9WUZ5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni1Q9WUZ5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni1Q9WUZ5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnni1Q9WUZ5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms