Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP1

Ramp3, Receptor activity-modifying protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ramp3Q9WUP1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ramp3Q9WUP1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ramp3Q9WUP1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms