Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stub1Q9WUD1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stub1Q9WUD1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms