Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp18Q9WTV6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp18Q9WTV6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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