Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PplQ9R269 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PplQ9R269 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PplQ9R269 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PplQ9R269 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PplQ9R269 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PplQ9R269 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PplQ9R269 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PplQ9R269 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PplQ9R269 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PplQ9R269 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PplQ9R269 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PplQ9R269 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PplQ9R269 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PplQ9R269 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms