Protein–RNA interactions for Protein: Q9R216

Fzd9, Frizzled-9, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fzd9Q9R216 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fzd9Q9R216 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fzd9Q9R216 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fzd9Q9R216 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fzd9Q9R216 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fzd9Q9R216 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fzd9Q9R216 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fzd9Q9R216 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fzd9Q9R216 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fzd9Q9R216 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fzd9Q9R216 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms