Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim3Q9R1R2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim3Q9R1R2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim3Q9R1R2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms