Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syt6Q9R0N8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt6Q9R0N8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms