Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
AmfrQ9R049 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms