Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh2d3cQ9QZS8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d3cQ9QZS8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms