Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ercc4Q9QZD4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms